1、國內客戶與外商簽訂出口合同，確定由國內出口貨物到國外。（此時國內出口商應當知道出口此類商品需要何種相應需要的出口監管證件，如出口許可證、商檢、配額證、機電證等）
2、國內出口商聯系運輸公司（或者在FOB條款下由國外客戶聯系運輸公司），通常出口商會通過貨代（或者直接與船公司聯系）作一站式服務（從產地一直到船邊的所有運輸過程）。
4、當貨物在安排拖車運輸前（或者運輸同時），出口商需要提供出口報關所必需的報關資料（外匯核銷單、出口合同、發票、裝箱單、報關委托書、以及根據貨物所受國家海關監管出口需要的證書：如許可證等），也有些沒有進出口權利的出口商可以通過貿易公司代理出口，由他們提供上述文件及辦理后續結匯收款及退稅的手續。甚至有些出口商可以不需要退稅，直接買份出口核銷單及報關資料報關出口，自己解決收款問題。
5、當貨物經拖車運到指定出口口岸（根據訂艙時的船公司及船名決定了出口口岸），貨柜進入碼頭堆場閘口時，開始受到口岸海關的正式監管，此時貨柜無論出入碼頭堆場都必須經過海關同意才能繼續運作。（有時貨柜回堆場后發現貨物短裝、質量有問題等，需要重新將貨柜提出碼頭，就必須向海關申請“監管出閘”手續，在海關查核實際情況與匯報相符的情況下監管貨柜離開碼頭堆場。）
6、當貨柜進入碼頭堆場后，碼頭電腦會紀錄此貨柜的進場時間、柜號、封條號、堆場位置等信息，并通過與海關電腦聯網受到海關電腦的監控。此時才可以正式向海關申報出口。
首先由報關公司通過聯網電腦向船代根據客戶提供資料輸入要報關的船名、航次、柜號、訂艙號、出口單位名稱、收貨人名稱、貨物名稱、件數、毛重等資料。船代收到資料并審核通過后會自動向海關電腦傳輸資料。（只有個別駁船公司需要船代公司負責審核上述內容，防止爆艙情況，一般船代在這里是不會每份具體審核的）。
海關電腦收到資料后也會自動通過，因此所有上述資料是由報關公司根據客戶提供的內容并且負責審核的。當海關電腦通過后，打印在空白裝船單上，（此時叫做裝船單（D/O），當海關電腦予以放行并且加蓋海關印章后，就叫做“放行條”。）
報關公司將裝船單上的內容（主要是16位數的運輸工具號碼及10位數的提運單號碼），通過海關允許的錄入公司，正式向海關的報關電腦系統申報出口（請注意，海關只承認當海關的電腦報關系統接收到申報時的時間為報關時間，之前這么多環節只算是準備環節，因此海關要求的“提前24小時申報”指的是在某條船截關前的24小時要向海關報關電腦系統申報，當然這個要求不太實際，因為有時路途運輸問題、貨物生產時間問題、報關資料交接問題等都有可能導致趕船的情況出現，最常見的信用證馬上到期，貨物剛剛好才生產出來，運到碼頭時當天就要截關。可是海關只有這樣才會立于不敗之地，因為趕不上船是我們沒有按海關要求辦事，不是海關做事慢而耽誤。
（個人意見，請勿傳播，謝謝），當海關報關系統接收到后會交由審單中心負責處理深圳各個口岸傳輸的報關數據，目前出口商品絕大多數是由電腦自動審單，只要發送到審單中心，就會自動通過，報關公司在發送前必須嚴格審核所申報的資料與客戶提供的內容完全一致。
審核通過后，打印出口報關單后，連同報關資料（核銷單、合同、發票等），報關員簽字、報關公司蓋章，向現場海關遞單。
首先遞單給綜合科，綜合科在電腦里確認接單，需要征稅的貨物轉給稅費組，一般貨物轉交給風險管理科，風險管理科認為需要查驗的貨物進行電腦布控，不要查驗的貨物直接放行，轉交給放行組加蓋海關印章后出單給報關行。
報關行將放行條交給碼頭進行電腦確認海關是否放行，確認后加蓋碼頭確認章，再由報關行將放行條交給船代公司，船代公司根據放行條裝船出口。
當船離開港口后，船代公司會在電腦發送一份此船實際裝船的艙單資料給海關的報關電腦系統，報關電腦系統與艙單資料對碰一致后才可以向海關申請打印出口外匯核銷聯及退稅聯。至此，全部報關環節完畢。
進口報關的基本流程
進口報關的基本程序：
接受申報→審核單證→查驗→辦理征稅→結關放行。
1.用換來的提貨單(1、3)聯并附上報關單據前去報關。
報關單據：提貨單(1、3)聯海關放行后，在白聯上加蓋放行章，發還給進口方作為提貨的憑證。正本箱單、正本發票、合同、進口口報關單一式兩份、正本報關委托協議書、海關監管條條所涉及的各類證件。
注意事項：
(1)接到客戶全真單據后，應確認貨物的，然后查閱海關稅則。確認進口稅率。確認貨物需要什么監管條件，如需做各種檢驗，則應在報關前向有關機構報驗。報驗所需單據：報驗申請單、正本箱單發票，合同、進口報關單兩份。
(2)換單時應催促船舶代理部門及時給海關傳艙單，如有問題應與海關艙單室取得聯系，確認艙單是否轉到海關。
(3)當海關要求開箱查驗貨物，應提前與場站取得聯系，調配機力將所查箱子調至海關指定的場站。(事先應現場站確認好調箱費、掏箱費。)
2.若是法檢商品應辦理驗貨手續。
如需商檢，則要在報關前，拿進口商檢申請單(帶公章)和兩份報單辦理登記手續，并在報關單上蓋商檢登記在案章以便。驗貨手續在最終目的地辦理。
如需動植檢，也要在報關前拿箱單發票合同報關單去代報驗機構申請報驗，在報關單上蓋放行章以便通關，驗貨手續可在通關后堆場進行。
3.海關通關放行后應去三檢大廳辦理三檢，向大廳內的代理報驗機構提供箱單、發票、合同報關單，由他們代理報驗。報驗后，可在大廳內統一窗****費，并在白色提貨單上蓋三檢放行章。
4.三檢手續辦理后，去港池大廳交港雜費。
港雜費用結清后，港方將提貨聯退給提貨人供提貨用。
5.所有提貨手續辦妥后，可通知事先聯系好的堆場提貨。
注意事項。
(1)首先應與港池調度室取得聯系安排計劃。
(2)根據提箱的多少與堆場聯系足夠的車輛盡可能按港方要求時間內提清。以免產生轉棧堆存費用。
(3)提箱過程中應與堆場有關人員共同檢查箱體是否有重大殘破，如有，要求港方在設備交接單上簽殘。
6.重箱由堆場提到場地后，應在免費期內及時掏箱以免產生滯箱。
7.貨物提清后，從場站取回設備交接單證明箱體無殘損，去船公司或代理部門取回押箱費。
